欢迎来到我的个人主页( www.biomath.cn )。我来自河北省邯郸市(中国成语典故之都),2005年从中央民族大学毕业之后,保送到南开大学攻读生物信息学博士学位,导师是沈世镒教授。2010年毕业之后加入到了南开大学数学科学学院信息与数据科学系。我目前对生物信息学、生物大分子结构与功能、细胞组学数据分析、数学与AI在生命科学中建模等领域感兴趣。
我们课题组寻找对科学研究真正感兴趣、有自驱力、勤奋、乐观、向上,同时具有良好编程能力、较高英语水平的学生,欢迎联系我gaojz#@#nankai.edu.cn (发信请时请将#去掉)。
所获奖励:
2020年08月,获天津市第十五届高校青年教师教学竞赛 三等奖
2020年06月,获南开大学青年教师教学竞赛 一等奖
2016年12月,获天津市“131”创新型人才培养工程第三层次人选
2005年06月,获北京市优秀毕业生
教学课程:
《生物信息学》,《数据科学导论》,《信息论》,《高等数学》,《一元函数微积分》,《文科高等数学》,《文科概率统计》等。
访学经历:
2023年09月12日 ~ 2024年03月11日 陈省身数学研究所。
2017年08月01日 ~ 2017年08月28日 到香港中文大学。
2015年09月 ~ 2016年05月 到澳大利亚Griffith 大学。
基金:
天津市自然科学基金面上项目、24JCYBJC01570、生物大分子复合物结构评估研究 、2024/10-2027/09、主持。
天津市卫生健康科技项目、MS20015、基于核磁影像的急性大血管闭塞脑梗死智能诊断方法研究、2020/08-2023/07、参加。
天津市自然科学基金青年项目、18JCQNJC09600、基于深度学习的蛋白质模型评估研究、2018/04-2021/03、主持。
国家自然科学基金青年项目、11701296、基于结构特征和机器学习的蛋白质结构模型评估新方法研究、2018/01-2020/12、主持。
教育部博士点基金、20130031120001、B细胞表位相关若干数学问题研究、2014/01-2016/12、主持。
The International Development Research Centre, Canada,104519-010、IDRC Research Chair in Modeling and Management of Communicable Diseases南开大学子项目、2009/08-2016/07、参加。
中央高校基本科研业务费、65011491、基于序列信息的构象型B细胞表位预测、2011/07-2013/06、主持。
部分论文:(# co-author * corresponding author)
[1] Chen Y# Lin S# Yang S# Qi M, Ren Y, Tian C, Wang S, Yang Y, Gao J*, Zhao H.*Genetic and phenotypic associations of frailty with cardiovascular indicators and behavioral characteristics. J Adv Res. 2024 Jun 9:S2090-1232(24)00249-2. doi: 10.1016/j.jare.2024.06.012 IF: 11.4 Q1 .
[2] Zeng, Y., Wei, Z., Yuan, Q., Chen, S., Yu, W., Lu, Y., Gao, J.*, & Yang, Y.* (2023). Identifying B-cell epitopes using AlphaFold2 predicted structures and pretrained language model. Bioinformatics, 39(4). https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad187 IF: 4.4 Q1
[3] Gao, J*., Zheng, S., Yao, M., & Wu, P. (2021). Precise estimation of residue relative solvent accessible area from Cα atom distance matrix using a deep learning method. Bioinformatics, 38(1), 94-98. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab616 IF: 6.931 Q1
[4] Wang, J., Chen, X., Hu, H., Yao, M., Song, Y., Yang, A., Xu, X., Zhang, N., Gao, J.*, & Liu, B.* (2021). PCAT-1 facilitates breast cancer progression via binding to RACK1 and enhancing oxygen-independent stability of HIF-1α. Mol Ther Nucleic Acids, 24, 310-324. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.02.034 IF:10.183 Q2
[5] Gao, J., Yang, Y., & Zhou, Y. (2016). Predicting the errors of predicted local backbone angles and non-local solvent- accessibilities of proteins by deep neural networks. Bioinformatics, 32(24), 3768-3773. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw549 IF:7.307 Q1